La hoya hidrográfica del Imperial cuenta con 12.054 km. Nace en la cordillera de los Andes y sus principales afluentes son el Cautín, Cholchol y el Quepe. En tanto, la hoya del Toltén tiene 78.886 km. y su principal afluente es el río Allipén. En su conformación intervienen el lago Caburga y el Villarrica.
